Semena se sklízí v době, kdy je většina z nich v plně vyzrálém stavu.

U praskajících šešulí (brukvovitá zelenina) je dobré plody sklízet ráno, kdy jsou ještě navlhlé a nevystřelují semena do okolí. Jdou lehce dosušit.

Semena obalena dožnatým oplodím jako je například rajče, dýně, melouny, okurky a další je potřeba zbyvit slizu, který je obklopuje. Postupujeme tak, že semena vložíme do nádoby s vodou a necháme je několik dnů v teple vykvasit. Potom je důkladně vyšušíme.

Veliký pozor je třeba dát u semen, pocházejících z přímého liniového křížení, označených F1. Laicky řečeno, pro to aby jste získali stejně hodnotné osyvo, museli by jste si odděleně pěstovat dvě odrůdy. Z jedné odstranit samčí květy (získáte matku), z druhé pak všechny samičí (získáte otce) a ty navzájem sprášit bez kontaminace cizího pylu.